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基因编辑专题09 | 攻克头颈癌实体瘤基因编辑难题,靶向CRISPR-LNP瘤内注射实现50%小鼠肿瘤完全清除
发布时间:2026-03-24

数据亮点快览

  • 肿瘤生长抑制率达 90%
  • 小鼠总体生存期延长约 90%(42天 → >84天)
  • 10 只小鼠中 5 只实现肿瘤病灶完全消退,未见复发
  • 全身及各器官安全性指标正常

研究背景:实体瘤 CRISPR 面临的三重枷锁

头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)发生于口腔、咽及喉部黏膜上皮,全球每年新增约60万例、30万人死于该病。目前标准治疗虽在持续进步,但约50%的局部进展期患者最终仍面临复发,5年生存率长期处于低位。这一现实迅速推动着将 CRISPR-Cas9 应用于实体瘤局部治疗的前沿探索。

然而,要实现实体瘤局部精准基因编辑,需要同时巧解三道屏障:

  • 递送屏障:实体瘤致密基质深度阻碍LNP渗透,全身给药LNP极易在肝脏大量蓄积,导致肿瘤局部实际摄取量极低。
  • 特异性屏障:就算LNP到达肿瘤局部,如何确保编辑事件仅发生在癌细胞,而非周边正常组织,仍是必须突破的关卡。
  • 靶点选择屏障:双链 DNA 断裂的脱靶风险要求靶基因必须是“癌症专属”的——高表达对癌细胞必不可少,而在正常成体组织低表达。

2024年12月,以色列特拉维夫大学 Dan Peer 教授团队在 Advanced Science 发表重磅论文,提出了一套系统性破题方案:瘤内注射 + 抗EGFR主动靶向 + SOX2癌症特异性敲除的三重策略组合。

靶点设计:为什么选SOX2 + EGFR?

▶ SOX2——癌细胞的“致命弱点”

SOX2是维持干细胞多能性的关键转录因子。在正常成体组织中严格受控、低水平表达;在HNSCC等多种癌症中则高度过表达,主导癌干细胞增殖、凋亡抗性与远处转移,是 HNSCC不良预后的独立预测因子。

更关键的是:来自全球最大功能基因组学平台“癌症依赖性图谱 (DepMap)”的大规模数据表明,SOX2具有极高的负依赖评分——敲除SOX2对癌细胞几乎是致命的,而正常成体组织低表达也意味着脱靶风险相对可控。这一特性使 SOX2 成为 HNSCC 的理想CRISPR 靶点。

▶ EGFR——递送与治疗的“一箭双雕”

EGFR在高达 90% 的 HNSCC 中过表达。将抗EGFR单克隆抗体包被于 LNP表面,实现了两重目标:

  • 递送实力:通过内吞转运(受体介导的内吞),显著提高EGFR高表达癌细胞对LNP的摄取效率与肿瘤内滞留。
  • 协同治疗:EGFR激活可通过STAT3通路上调SOX2表达;抗EGFR抗体包被因此在递送SOX2 sgRNA的同时,对SOX2高表达形成额外的信号通路抑制,两者协同、效果远超单一干预。

技术路径:三步实操构建靶向 CRISPR 纳米武器

▶ Step 1:筛选高效 sgRNA

在 UMSCC-104(口腔癌)和 FaDu(下咽癌)两株细胞系中,对 3 条 SOX2 sgRNA进行 RNP 转染筛选。sgSOX2-A 表现最优:UMSCC-104 中实现 58%基因编辑、FaDu 中实现40%编辑,并导致两株细胞系活力分别下降至对照组的约 40% 和 62.5%。该 sgRNA被选定为后续所有体内外实验的核心 guide。

▶ Step 2:筛选最优可电离脂质配方

采用微流控混合将化学修饰的Cas9 mRNA 与 sgRNA 共封装于 LNP,筛选包含 5 种专有可电离氨基脂质(L14、L15、L24、L30、L31)的 LNP 配方。所有配方粒径 80–100 nm、PDI < 0.2、包封率 >85%。

L31配方脱颖而出:10 μg/mL 剂量下实现 88% 细胞活力抑制,Sanger 测序确认 SOX2 Indel 评分高达 68%,全面领先其余四种脂质,被选定为体内实验核心载体。

▲ CRISPR-LNP的有效性。图源:参考文献[1]

▶ Step 3:ASSET 策略构建抗EGFR 靶向 cLNP

利用非共价的 ASSET 连接策略,将抗人 EGFR 单克隆抗体均匀包被于 L31-LNP 表面,抗体偶联效率接近 100%。小鼠体内生物分布实验确认:EGFR-tLNP 在肿瘤部位的荧光素酶表达量显著高于裸LNP与同型对照组,流式细胞术进一步确认其在 CD44⁺ 癌细胞中的高摄取率。肝脏与脾脏中并未检出任何脱靶编辑,安全性得到完整验证。

动物实验:从统计数据到完全清除

荷瘤小鼠在肿瘤体积达约50 mm³(接种后第 10 天)时,于第 10、17、24 天接受三次瘤内注射(1 mg/kg),分为四组:

  • T-sgSOX2:靶向 tLNP + SOX2 敲除 guide(核心治疗组)
  • I-sgSOX2:非靶向 LNP + SOX2 敲除 guide
  • T-sgNC:靶向 tLNP + 无关序列对照 guide
  • I-sgNC / PBS:阴性对照

核心疗效数据

  • T-sgSOX2 组肿瘤生长抑制率达 90%(相比 I-sgNC,第 6 周)
  • 总体生存期延长 ~90%(42 天 → >84 天),10/10 小鼠存活超过 42 天
  • 10 只小鼠中 5 只实现肿瘤病灶完全消退,未见复发
  • I-sgSOX2 组前 6 周同样有效,但后续出现复发趋势,凸显主动靶向的关键作用
  • 肝、肾功能指标及三大炎症因子(TNFα、IL-10、IL-1β)均无异常,安全性良好

▲ αEGFR-SOX2-LNP介导异种移植HNSCC小鼠模型中的治疗性基因编辑。图源:参考文献[1]

关于主动靶向的可能机制:除提升LNP对癌细胞的渗透和内化效率外,EGFR抗体包被同时阻断了EGFR信号通路的SOX2转录激活途径,形成SOX2基因敲除与EGFR信号阻断的协同效应。

研究展望:三重策略为实体瘤CRISPR疗法提供可复制范本

该研究构建了一个高度可转化的实体瘤CRISPR治疗范式,其逻辑清晰、可复制性强,在12周随访中展现了持续接近完全缓解的疗效证据。其转化案例价值不仅限于HNSCC,同样适用于其他具有临床可视/可触及病灶的实体瘤(乳腺癌、皮肤癌、甲状腺癌等)。三项关键设计原则具有普适性:

  • 瘤内给药:规避肝脏脱靶,适合临床可及的局部病灶,深部病灶可借助内镜/超声引导。
  • 抗体靶向修饰:高效特异性内化,并与相应信号通路协同,确保持续治疗响应。
  • 癌症专属靶点:安全性与疗效的「双重保险」,逐步推广至具有局部高依赖性致癌基因的其他癌种治疗范式。

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  • mRNA + sgRNA 共递送 LNP:高包封率(>85%)、低 PDI(<0.2)、粒径80–150 nm,支持化学修饰 Cas9 mRNA 与高修饰sgRNA 的共封装。可直接用于体外细胞转染或小鼠瘤内注射实验。
  • 抗体靶向修饰 LNP:支持将客户指定靶向抗体(如抗EGFR、抗CD3、抗PD-L1等)包被于LNP表面,制备ASSET类似策略的靶向递送系统,助力建立体内靶向活性评估模型。
  • 开箱即用、标准化配方:每批均完成 DLS、RiboGreen 包封率等全项质控,提供现货或定制小批量服务。无需自建微流控平台,缩短实验准备周期,快速融入你的科研体系。
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封面图来源:Freepik.com

参考文献:

[1] Masarwy et al., Targeted CRISPR/Cas9 Lipid Nanoparticles Elicits Therapeutic Genome Editing in Head and Neck Cancer, Advanced Science (2024). DOI: 10.1002/advs.202411032

关于晟迪生物

晟迪生物专注于以自主创新的纳米载体技术为核心,推动RNA疗法及其他合成生物学技术的创新研究与临床转化。公司建立了人工智能与合理实证驱动的全链条LNP递送技术解决方案(TLS),拥有核心脂质材料库、NeoLNP™系列试剂盒(干细胞/免疫细胞/动物体内RNA转染)和RNA序列设计模型,并成功开发了以肺部雾化吸入、皮肤局部给药为代表的i-Core LNP™肝外靶向RNA递送方案

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